Para Diciembre de 2003, SaludCoop inauguró el Centro Nacional de Investigación , con el objeto de fomentar la Investigación como mecanismo para identificar y resolver situaciones que tengan que ver con la salud de los afiliados a la EPS . Actualmente se encuentran en curso investigaciones relacionadas con vacunas, la depresión, el virus del papiloma Humano, prácticas basadas en evidencia en el cuidado del embarazo, trabajo de parto y recien nacidos en hospitales colombianos, entre otras.
